如果地下停车库属于小区配套设施，其权利归全体业主拥有，则不能单独办理房地产证;若地下停车库的权利在转让时有事先约定，并已缴清地价，办理初始登记时依据约定，确认登记人的权利，可以发房地产证。
房产证办理程序
1、企业持应提交的证件，向房管所提出申领房产证的申请;产权人必须填写申请书，并交验有关证明、证件;经审查符合登记条件的，予以收件。即接受申请书，收存需要进一步审查的有关证明、证件。
2、初审：办证员对申请和提交的资料进行初审，符合条件的马上受理并开具收件回执，约定现场查丈时间;
3、查丈：办证员在预定的时间内到现场实地查丈，确定房屋的位置、结构、面积，绘制平面简图并注明尺寸和四邻墙界;勘丈绘图。它是对已申请产权登记的房地产逐户、逐处进行实地勘察，查清房地现状，丈量计算面积，核实墙体归属，绘制分丘平面图，补测或修测房屋分幅平面图，为产权全面审查和制图发证提供依据。
4、审批：依据申请资料和查丈结果，对符合政策规定的给予审批，确定房屋产权; 产权审查是以产权档案的历史资料和实地调查勘察的现实资料为基础，以国家现行的政策、法律和有关的行政法规为依据，对照申请人提交的申请书、墙界表、产权证件、证明，逐户、逐栋认真审查其申请登记的房屋产权来源是否清楚，产权转移和房屋变动是否合法等整个复杂细致的工作过程。
5、绘制权证。对申请人申请的房地产，经过审查确认可以颁发产权证后，应及时转入制权证阶段。这个阶段的主要工作是绘制应颁发的产权证件。
6、交费：申领房产证的产权人按规定交纳办证费;它是产权登记发证工作的最后程序，要求把应收的登记费收缴入库。
7、发证：房管部门在规定的时间(40个工作日内)办理完毕，房屋产权人到房管所领取房屋所有权证。发放产权证前，必须全面检查应发放的权证有无差错，是否已交纳契税。